Der heutige Standort der Isontina-Staatsbibliothek wurde ab Mitte des 19. Jahrhunderts vom Kaiserlich-Königlichen Staatsgymnasium genutzt.

In dieser Schule, die auch von slowenischen und kroatischen Schülern besucht wurde, schloss der Philosoph Carlo Michelstaedter zu Beginn des zwanzigsten Jahrhunderts seine erste Ausbildung zusammen mit seinen Freunden Nino Paternolli, Enrico Mreule und Biagio Marin ab.

Die Staatsbibliothek Isontina beherbergt auch die „Carlo Michelstaedter Sammlung“, die eine bedeutende Sammlung von Zeichnungen, Gemälden, Briefen und Manuskripten umfasst. Sie wurde 1973 auf Anordnung von Paula, der Schwester des Philosophen, gegründet.